用于脑部MRI的调情注册工具给出了令人难以置信的结果

Question

我有一个脑部核磁共振成像，它包含了这个角度的切片：

我在玩脑磁共振成像的注册工具，名为Flirt。该代码也可用于Python

我试着用另一个病人的不同角度的脑部MRI作为参考。这里是从这个MRI中获取的切片（所有文件都是nifti格式）：

现在，奇迹发生了。将第一个MRI作为注册工具的输入，最后一个MRI作为参考MRI

结果是，注册工具（调情）的输出是一个MRI，其中切片具有以下角度：

因此，注册工具似乎从输入的MRI中提取了参考MRI的角度。这真是难以置信。这怎么可能

Answer 1

您使用什么包装来转换dicom图像？dcm2niix包装器将自动应用转换以正确定位它。调情是一个功能强大的工具，可以很好地进行注册。许多预处理管道（如fmriprep）已经在使用它。我对它是如何解释图像的倾斜感兴趣。查看此处的用法页面https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FLIRT/UserGuide没有看到任何关于它的说明。我想知道它是否只是覆盖了MNI模板上每个体素的激活。首先确定nifti图像的方向，然后再次运行它，这将是一个很好的测试。
您可以为无方向和有方向的图像创建一个遮罩，并将其穿过，然后使用细分程序检查特定ROI中的体素计数，以查看两个遮罩的体素计数是否相同

我很想看看你发现了什么