我在使用networkx将数据帧表示为网络时遇到困难。问题似乎与数据帧的大小有关,或者,为了更好地解释,与数据帧中是否存在重复项有关
我的数据集是
Src Dst
x.serm.cool [x.serm.cool, x.creat.cool]
x.creat.cool [x.creat.cool, x.serm.cool]
sms.sol.tr [sms.sol.tr]
bbb.asl.gt [bbb.asl.gt,cdc.fre.gh,str.alert.jf]
cdc.fre.gh [cdc.fre.gh, bbb.asl.gt,str.alert.jf]
str.alert.jf [str.alert.jf, bbb.asl.gt, cdc.fre.gh]
...
x.serm.cool [x.serm.cool]
其中Src
的值用作节点Dst
用作边。这意味着,例如,x.serm.cool
有两个链接,一个链接自身(但不需要考虑),另一个链接x.creat.cool
。另一个例子:str.alert.jf
有三个链接:一个链接本身(但它没有价值);一个带bbb.asl.gt
,另一个带dc.fre.gh
。所有链接都是无方向的。
我尝试使用不同的颜色表示列表中的一些节点:
df["color"] = "blue"
df.loc[df.Src.isin(["x.serm.cool", "cdc.fre.gh "]), "color"] = "green"
df["Dst"] = df.Dst.apply(lambda x: x[1:-1].split(","))
G = nx.from_pandas_edgelist(df.explode("Dst"), 'Src', 'Dst')
nx.draw(G, node_color = df.color)
但我收到了错误消息,原因是:df["Dst"] = df.Dst.apply(lambda x: x[1:-1].split(","))
。
正如YOBEN_S在一个相关问题中所解释的(请参见问题底部),问题在于考虑列表而不是字符串。
然而,当我尝试以下方法时:
test=["x.serm.cool", "cdc.fre.gh "]
df['color'] = np.where(df.Src.isin(test), "blue", "green")
G = nx.from_pandas_edgelist(df.explode("Dst"), 'Src', 'Dst')
nx.draw(G, node_color = df.color)
我得到这个错误:
ValueError: 'c' argument has 79 elements, which is inconsistent with 'x' and 'y' with size 76.
我的原始数据集的长度为79
,而76
似乎是没有Src
重复项的数据集的长度/大小。我认为副本可能很重要,因为它们给出了节点的大小,所以我不希望将它们从我的数据集和网络中删除
你能帮我解决这个问题吗
相关问题和答案:
您面临的问题是因为数据中的某些项是重复的。要解决此问题,您需要在相关位置使用
drop_duplicates
:输出:
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