在Python中运行lmer（线性混合效果回归）

Question

我想问一些关于在Python中运行lmer（线性混合效应回归）模型的问题

下面是我在lme4包（在R中）中运行的两行（或公式）。在Python中有什么方法可以适合下面的模型吗

1. TEST1 <- score ~ p1 + p2 + p3 + (1|v1) + (1|v2), data = df, control = lmerControl(boundary.tol = 1e-4, calc.derivs = FALSE))
2. TEST2 <- score ~ (1|v1) + (1|v2), data = df, control = lmerControl(boundary.tol = 1e-4, calc.derivs = FALSE))

Answer 1

如果不需要在Python中实际运行模型，那么可以直接从Python环境中调用并运行R中的LMER模型

您可以通过Rpy2&；rmagic或通过Pymer4。这两个选项都允许您在R中使用lme4包，并提供从Python环境（如jupyter笔记本）调用它们的选项

我写了一篇教程，介绍了如何使用这里提供的示例来实现这一点：https://towardsdatascience.com/how-to-run-linear-mixed-effects-models-in-python-jupyter-notebooks-4f8079c4b589

正如EJJ所指出的，在Python中有LMER的实现，例如在statsmodels和Tensorflow中，但是它们的使用似乎不如上述方法直观