错误：无法为（分开的）GRM GCTA 64/python分配足够的内存

Question

我正在通过python通过os.system（）使用gcta64处理一些遗传数据（在屏幕上）。但是，我遇到了一个内存问题。 我的机器是一个来自谷歌云的VM实例，内存为1 TB

第一张图片是我的htop的屏幕截图，第二张是代码/错误的屏幕截图。 你可以清楚地看到我有足够的记忆力。另外，我正在运行另一个任务，但我认为这不是问题所在。我停止了它并运行了gcta任务，但我得到了相同的错误。 谢谢,

非常感谢

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Answer 1

你可以分割数据 使用 make-grm-part n i 其中n是折叠数，i是第i个折叠。例如： 你想除以3吗

 make-grm-part 3 1 ...
 make-grm-part 3 2 ...
 make-grm-part 3 3 ...

您可以连接结果。 有关更多信息，请参阅https://cnsgenomics.com/software/gcta/#MakingaGRM下的“制作grm零件”讨论