emcee EnsembleSampler对象没有属性get_链

Question

使用get_chain（）方法访问从emcee生成的值时遇到问题。我的代码如下：

import numpy as np
import emcee
def log_prob(x): return -np.sum(x**2)
p0 = np.array(np.random.randn(12, 1))
sampler = emcee.EnsembleSampler(12, 1, log_prob)
sampler.run_mcmc(p0, 1000)
samples = sampler.get_chain()

当我运行这个程序时，会收到消息AttributeError: 'EnsembleSampler' object has no attribute 'get_chain'，我不知道为什么。 我在网上的某个地方读到get_chain（）方法只是在较新版本的emcee中添加的，需要从GitHub下载。如果这是一个问题，我将如何从GitHub下载它并确保它仍然与Anaconda一起工作（我是Python/GitHub新手，我不太熟悉如何完成）

任何帮助都将不胜感激！谢谢

Answer 1

正如您所怀疑的，这可能是由于安装了旧版本的主持人。您可以检查安装的版本

emcee.__version__

emcee3在相当长的一段时间内只是一个候选版本（而不是正式版本），因此您阅读的博客文章给出了建议。它已经发布了，然而，这篇文章可能至少有将近一年的历史了。您应该能够更新到最新的主持人，并通过pip解决您的问题

pip install -U emcee

或者使用conda（看起来像您正在使用的）

conda install -c conda-forge emcee

请参阅有关主持人在其conda forge page上安装conda的更多详细信息