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Numpy:填充共现矩阵的最快方法
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<p>我有一个很长的索引元组列表(大量重复),以及一个n×n索引矩阵。每个元组表示一个共现</p> <p>例如:</p> <pre><code>a = np.zeros(shape=(indexCount,indexCount)) </code></pre> <p>我试过这个:</p> <pre><code>for i1,i2 in coocPairs: #for instance (2374, 22003) a[i1][i2}+=1 #takes way too long </code></pre> <p>或:</p> <pre><code>np.put(a,coocPairs,1) #which obviously does not increment </code></pre> <p>或者:</p> <pre><code>np.add(a,coocPairs,1) #which takes even longer. </code></pre> <p>在一个理想的世界中,会有一个函数接受我的元组列表,并用它构建一个共现矩阵,但唉(doc.不是很有帮助)。我认为解决方案可以更多地放在代码的python方面,但我已经没有想法了。欢迎任何帮助。谢谢你抽出时间</p>
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>您可以使用<code>np.add.at</code></p> <pre><code>np.add.at(a,tuple(coocPairs.T),1) </code></pre> <p>如果速度不够快,则会有更快但更不直接的基于<code>np.bincount</code>的解决方案。这些依赖于使用<code>np.ravel_multi_index</code>的平坦索引</p>
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