如何解决安装Scanpy时出现的“不兼容numba”错误？

Question

我尝试在Jupyter上安装带有“pip install Scanpy”的Scanpy软件包，但出现以下错误

错误：pynndescent 0.5.2有要求numba>=0.51.2，但您将拥有不兼容的numba 0.48.0。错误：umap learn 0.5.1有要求numba>=0.49，但您将拥有不兼容的numba 0.48.0

当我试图单独安装升级版的numba时，我遇到了以下错误：

错误：无法卸载“llvmlite”。这是一个distutils安装的项目，因此我们无法准确确定哪些文件属于它，这只会导致部分卸载。

Answer 1

您可以尝试使用pip install-c numba numba=0.51.2.1rc1进行安装，如果它对您不起作用，请在pip安装numba之前运行pip install llvmlite ignore installed。 祝您愉快：）

Answer 2

1. 运行pip install upgrade numba
2. 运行pip install scanpy