如何安装在“Resentials”中不可用的R软件包？

Question

我使用现成的Anaconda安装来处理Python。现在我已经读到，在这个安装中也可以“包括”R世界，并在Jupyter/Ipython笔记本中使用IR内核

我找到了安装许多著名R软件包的命令： conda安装-c r-essentials

我的初学者问题：

如何安装未包含在R-essential软件包中的R软件包？例如，CRAN上提供的R软件包。“pip”只适用于PyPI-Python包，不是吗

Answer 1

现在我找到了文档：

这是解释如何生成仅在CRAN存储库中可用的R包的文档： https://www.continuum.io/content/conda-data-science

转到“构建conda R包”一节

（提示：只要R包在anaconda.org下可用，请使用此资源。请参阅此处：https://www.continuum.io/blog/developer/jupyter-and-conda-r）

alistaire的答案是另一种添加R包的可能性：

如果您通过常规的install.packages（从CRAN镜像）或devtools::install_github（从GitHub）从R内部安装包，它们工作正常@阿利斯泰尔

如何操作： 打开（独立）R安装，然后运行以下命令：

install.packages("png", "/home/user/anaconda3/lib/R/library")

要将新包添加到Jupyter使用的正确R库中，否则该包将安装在.libpath（）中提到的/home/user/R/i686 pc linux gnu库/3.2/png/libs中

Answer 2

在Jupyter上安装R-essentials以外的其他R软件包

install.packages('readr', repos='http://cran.us.r-project.org')

一个问题是特定的存储库是US.R-Project（如下所示）。我试过其他人，但没有成功

注意：将readr替换为任何需要安装的包名

Answer 3

这是一个以康达为中心的答案。它基于Frank的答案和continuum网站：https://www.continuum.io/content/conda-data-science提供了更多细节

一些r-essentials中不可用的软件包在conda频道上仍然可用，在这种情况下，很简单：

conda config --add channels r
conda install r-readxl

如果需要构建软件包并使用conda进行安装：

conda skeleton cran r-xgboost
conda build r-xgboost
conda install --use-local r-xgboost

最后一行在continuum网站中不存在，因为他们假设它首先发布到anaconda存储库。没有它，任何东西都不会放在envs/目录中，并且命令行R或Jupyter无法访问该包

在mac上，我发现为包构建安装Clang编译器很重要：

conda install clangxx_oxs-64