用python加载MITBIH心律失常数据库

Question

要使用的最佳文件格式是什么？如何正确加载数据库并用python绘制sgnals 我正在使用来自https://physionet.org/physiobank/database/mitdb/的.dat文件 我用了这些密码

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 
data = np.genfromtxt('100.dat',delimiter=',')
print(data)

我得到了一个错误：

*第1867行，genfromtxt格式 提升值错误（errmsg）

值错误：检测到一些错误！ 第3行（有2列而不是1列） 第6行（有4列而不是1列） 第9行（有3列而不是1列） 第11行（由1列改为3列） 第12行（有2列而不是1列） 第16行（由1列改为3列） 第17行（由1列改为2列） 第18行（有3列而不是1列） 第20行（由1列改为2列） 第23行（由1列改为2列） 第27行（由1列改为2列） 第36行（有2列而不是1列） 第37行（有2列而不是1列） 第#66行（由1列改为2列） 第67行（有2列而不是1列） 第100行（由1列改为2列） 第105行（由1列改为2列） 第106行（由1列改为2列） 第118行（由1列改为2列） 第120行（由1列改为5列） 第#122行（由1列改为3列） 第123行（有4列而不是1列） 第#125行（由1列改为2列） 第#126行（由1列改为2列） 第127行（有3列而不是1列） 第128行（有2列而不是1列） 第134行（由1列改为2列） 第135行（由1列改为2列） 第137行（有2列而不是1列） 第141行（由1列改为3列） 第143行（由1列改为3列） 第146行（由1列改为2列） 第147行（由1列改为2列） 第148行（由1列改为2列） 第149行（由1列改为2列） 第#152行（由1列改为3列） 第154行（由1列改为2列） 第#156行（由1列改为4列） 第162行（由1列改为2列） 第#163行（由1列改为2列） 第167行（有3列而不是1列） 第#168行（由1列改为2列） 第174行（由1列改为2列） 第175行（由1列改为2列） 第#176行（由1列改为3列） 第177行（由1列改为2列） 第179行（由1列改为2列） 第#186行（由1列改为2列） 第187行（有3列而不是1列） 第#188行（由1列改为2列） 第189行（由1列改为3列） 第191行（由1列改为2列） 第193行（由1列改为2列） 第196行（由1列改为2列） 第199行（由1列改为2列） 第202行（由1列改为2列） 203行（有2列而不是1列） 第204行（由1列改为2列） 209行（有4列而不是1列） 第210行（有4列而不是1列） 211行（有2列而不是1列） 第213行（有2列而不是1列） 第218行（由1列改为2列） 第222行（由1列改为2列） 第223行（由1列改为3列） 第#228行（由1列改为2列） 第236行（由1列改为2列） 第240行（由1列改为2列） 第241行（由1列改为2列） 第244行（由1列改为3列） 第246行（由1列改为2列） 第255行（有2列而不是1列） 第#257行（由1列改为2列） 第#268行（由1列改为2列） 第269行（有2列而不是1列） 第271行（由1列改为2列） 第273行（有4列而不是1列） 第#280行（由1列改为2列） 第#281行（由1列改为2列） 第291行（有2列而不是1列） 323行（有2列而不是1列） 第325行（由1列改为2列） 第334行（得到2列而不是1列） 第340行（由1列改为2列） 第341行（有2列而不是1列） 第342行（得到2列而不是of 1） 第#364行（由1列改为2列） 第#372行（由1列改为3列） 第375行（由1列改为2列） 第378行（有6列而不是1列）*

Answer 1

您应该使用wfdb-python包。文档非常好，有很多例子。要在您的环境中安装它，只需执行pip install wfdb。在

假设您在名为./mitdb的本地目录中拥有数据文件（包括上面提到的100.dat文件），则可以读取包含以下内容的记录：

import wfdb
record = wfdb.rdsamp('mitdb/100', sampto=3000)
annotation = wfdb.rdann('sampledata/100', 'atr', sampto=3000)

然后可以使用以下函数绘制数据：

^{pr2}$

如果本地还没有数据文件，可以使用wfdb下载它们：

import os
wfdb.dldatabase('mitdb', os.path.join(os.getcwd, 'mitdb'))

这将下载记录并将其保存在名为mitdb的本地目录中