我有一个很大的文本文件,文件大小为很多GB。现在我想看看一些字符串(保存在变量中)是否在我的大文件中。我发现函数split()将占用大量内存,因此我正在寻找一种新方法
我的代码如下所示:
save_file=open('path_here' + datetime.now().strftime("%d-%m-%Y_%H-%M")+'_output_all.fasta', 'w+')
...
inter_res = "(9|D)(12|S)"
if inter_res in save_file:
print("yeah")
else:
print("oh no")
在这种情况下,我知道inter_res
中的信息在我的大文件中
大文件如下所示(几行):
>nxp:NX_A0A075B6N4-1_(54|H)_positions: 51-76 MYWHQQDPGMELHLIHYSYGVNSTEK
>nxp:NX_A0A075B6N4-1_(54|H)(57|V)_positions: 51-76 MYWHQQVPGMELHLIHYSYGVNSTEK
>nxp:NX_A0A075B6N4-1_(54|H)(57|V)(59|E)_positions: 51-76 MYWHQQVPEMELHLIHYSYGVNSTEK
>nxp:NX_A0A075B6N4-1_(54|H)(57|V)(59|E)(59|R)_positions: 51-76 MYWHQQVPRMELHLIHYSYGVNSTEK
>nxp:NX_A0A075B6N4-1_(54|H)(57|V)(59|E)(59|R)(64|F)_positions: 51-76 MYWHQQVPRMELHFIHYSYGVNSTEK
>nxp:NX_A0A075B6N4-1_(54|H)(57|V)(59|E)(59|R)(64|F)(65|S)_positions: 51-76 MYWHQQVPRMELHFSHYSYGVNSTEK
>nxp:NX_A0A075B6N4-1_(54|H)(57|V)(59|E)(59|R)(64|F)(65|S)(65|T)_positions:
51-76 MYWHQQVPRMELHFTHYSYGVNSTEK
有人能给我一个方法来找到我的变量的值吗?谢谢
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