错误：命令“gcc”失败，退出状态为1，安装Fatiando（Python包）

Question

我正在尝试安装fatiando，一个Python的地球物理建模包。 我有一台苹果操作系统v10.9.5。通过遵循package site上建议的安装，我获得了Fatiando的所有依赖项（通过Anaconda）。我已经安装了Xcode。在

我得到一个警告列表和最后一条错误消息：

    fatiando/gravmag/_polyprism.c:349:10: fatal error: 'omp.h' file not found

    #include "omp.h"

             ^

    1 warning and 1 error generated.

    error: command 'gcc' failed with exit status 1

    ----------------------------------------
    Command "//anaconda/bin/python -c "import setuptools, tokenize;__file__='/var/folders/32/mwq0jhwd3dx7vjqmm8hkljp80000gn/T/pip-QFjo6d-build/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /var/folders/32/mwq0jhwd3dx7vjqmm8hkljp80000gn/T/pip-CY4vyX-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile" failed with error code 1 in /var/folders/32/mwq0jhwd3dx7vjqmm8hkljp80000gn/T/pip-QFjo6d-build
Macintosh-5:fatiando matteoniccoli$ 

完整的终端输出（1100+行）可以找到here。在

我已经联系了开发人员，这似乎不是法蒂安多的问题。在

有什么建议吗？在

更新，3月15日

当我第一次发布这篇文章时，我没有Xcode，然后我从苹果商店下载了最新的Xcode。再试一次，得到同样的信息。然后我阅读this，从here下载gcc，并直接安装。当我在终端上输入：gcc --version时，我得到的是：i686-apple-darwin11-llvm-gcc-4.2 (GCC) 4.2.1 (Based on Apple Inc. build 5658) (LLVM build 2335.15.00) 不过，在那之后，我仍然收到类似的信息。遵循另一个stackoverflow线索，我试图从here安装setuptools 使用curlhttps://bootstrap.pypa.io/ez_setup.py-o-| python 现在，当我尝试安装fatiando时，我得到了一个不同的错误（在长输出的末尾）：

^{pr2}$

一个论坛的人通过电子邮件问我： 你安装了Xcode命令行工具吗？看看这个 http://railsapps.github.io/xcode-command-line-tools.html

但是，当我试图验证tI是否按照建议成功地安装了Xcode命令行工具时，我发现了这一点，所以我认为这不是问题所在：

-bash: /Library/Developer/CommandLineTools: is a directory

3月16日更新 利奥·乌伊田提出的尝试性解决方案。在

pip安装--upgrade https://github.com/fatiando/fatiando/archive/kill-omp.zip没有问题，但是

pip install --upgrade https://github.com/fatiando/fatiando/archive/master.zip让我回到1号广场：

...
...    
fatiando/gravmag/_polyprism.c:349:10: fatal error: 'omp.h' file not found

        #include "omp.h"

                 ^

        1 warning and 1 error generated.

        error: command '/usr/bin/clang' failed with exit status 1

        ----------------------------------------
        Rolling back uninstall of fatiando

Answer 1

（知道您使用的gcc版本会很有用。）

gcc在v4.9之前没有与OpenMP一起提供。在

Seethis answer可以帮助您使用xcode更新gcc-it。在

Answer 2

这是Fatiando安装中非常常见的问题，特别是在Windows和Mac上。OpenMP是在PR 106中为fatiando.gravmag正向建模模块引入的。它很容易实现（只需将range(ndata)替换为prange(ndata)），并且比顺序执行的速度提高了1.5-2倍。同时，并行执行是自动的。所以在当时看来这是一个很好的权衡（“只是安装一个额外的依赖项？会出什么问题？”）。在

当Pythongcc和默认Mac gcc没有随OpenMP一起提供时，问题就开始了。因此，Windows用户必须安装一个额外的依赖项（按照一个非常特殊的顺序，就像撒旦的仪式一样），而Mac用户则不得不自食其力。在

OpenMP和编译过的Cython模块将从Fatiando（#169）中删除，而不是multiprocessing和{}。这将使它成为一个纯Python包（不需要编译），大多数安装问题都应该得到解决。在

同时，PR 177从Cython模块中删除OpenMP需求。这将修复当前的安装问题。要立即获得更改，可以从kill-omp分支安装版本，方法是运行：

pip install  upgrade https://github.com/fatiando/fatiando/archive/kill-omp.zip

如果上面的命令不起作用，这意味着pull请求已经合并到项目的主分支（master）中。如果是这样，您可以从master分支安装最新版本：

^{pr2}$

这些更改将包含在未来的v0.4版本中。希望这能解决你的问题。在