在python中使用索引进行更快的字符替换

Question

我有一大套150万的DNA序列 每一个都有来自ATCG集合的大约1k个字符

我正在模拟错误突变，这需要很多时间才能完成。我已经确定了我的瓶颈，即更改字符串字符的函数：

def f(sequence, indexes_to_mutate):
     seq = list(sequence)
     for i in indexes_to_mutate:
         seq[i] = 'X'

     return ''.join(seq)

有没有一种更快的方法来操作字符串，而不必先转换为列表，然后再转换回字符串

Answer 1

根据this答案，以下方法将比转换为列表并返回更快：

def f(sequence, indexes_to_mutate):
     for i in indexes_to_mutate:
         new_seq = sequence[:i] + 'X' + sequence[i+1:]

     return new_seq