我正在用随机游走算法从MRI序列中分割髂骨。我从序列中最简单的切片中分割出来,然后我想使用先前的骨骼分割(侵蚀和扩张)作为内部和外部标记来迭代序列。我使用以下代码来标记标记:
markers = np.zeros(bone_mark.shape)
out_mark = np.invert(dilation(bone_mark, disk(10)))
in_mark = erosion(bone_mark, disk(5))
markers[out_mark == True] = 1
markers[in_mark == True] = 2
其中bone_mark
是上一层髂骨的分割。它第一次工作正常,但当我在循环中运行时,第二次迭代无法在标记数组中组合标签。在这里,您可以看到第一次和第二次迭代中的标记图像示例:
我在两个迭代中都检查了out_mark
和in_mark
,它们都很好,就像它们应该的那样。它看起来很神秘,我不知道如何解决这个问题。你能谈谈你对这个问题的看法吗
我发现了问题,这是由于输出类型
skimage.segmentation.random_walker
不是bool
,而是:我的情况也是这样
最简单切片的第一次分割是用另一种算法完成的,这是一个布尔数组
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