GP回归模型预测所有测试输入非常相似的数字

2024-09-28 05:22:17 发布

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我用氨基酸序列的doc2vec包埋来预测动力学速率。你知道吗

我试过标准化和不标准化我的输入向量(X),但是除非我标准化我的输出变量(动力率),否则我的GP模型预测所有测试输入的非常相似的数字(在4.87和4.9之间)?你知道吗

你是应该标准化你的输出值还是我的模型有问题?你知道吗

我使用的是Python中的GPy包。你知道吗

这是我的密码:

#GP Regression for word vectors
def Gp_regression(Xtrain, Ytrain, Xtest, Ytest):

    kernel = GPy.kern.RBF(input_dim = 64, variance = 1, lengthscale =    1)
    m = GPy.models.GPRegression(Xtrain, Ytrain, kernel=kernel,    noise_var=1e-10)
    m.optimize_restarts(num_restarts = 10)

    Xtest = np.ndarray(shape=(1,64))
    mean = m.predict(Xtest)

return mean

Tags: 模型速率序列动力学meankernel向量动力

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