根据表中的另一列值更改列值

Question

我在python中有一个数据帧，例如：

seqnames    start   end name    number  strand
     A       50     453   A      1        -
     B       30     322   A      2        -
     C       10     432   A      3        -
     D       36     344   A      4        +
     E       40     321   A      5        +
     F       78     234   A      6        -

我想根据strand column中的符号来更改start和end列中的de值。你知道吗

所以对于每一行，如果strand是-，那么start+1和end-2 如果链是+，那么什么也不做

我应该得到：

seqnames    start   end name    number  strand
A   51  451 A   1   -
B   31  320 A   2   -
C   11  430 A   3   -
D   36  344 A   4   +
E   40  321 A   5   +
F   79  232 A   6   -

谢谢你的帮助

Answer 1

使用^{}：

df['start'].mask(df['strand']=='-',df['start']+1,inplace=True)
df['end'].mask(df['strand']=='-',df['end']-2,inplace=True)

---

print(df)

  seqnames  start  end name  number strand
0        A     51  451    A       1      -
1        B     31  320    A       2      -
2        C     11  430    A       3      -
3        D     36  344    A       4      +
4        E     40  321    A       5      +
5        F     79  232    A       6      -

---

也可以使用^{}+^{}：

df[['start','end']]=( df[['start','end']]
                   .apply(lambda x: pd.Series((x['start']+1,x['end']-2)).rename({0:'start',1:'end'}),axis=1)
                   .where(df['strand']=='-',df[['start','end']])
                    )

print(df)
  seqnames  start  end name  number strand
0        A     51  451    A       1      -
1        B     31  320    A       2      -
2        C     11  430    A       3      -
3        D     36  344    A       4      +
4        E     40  321    A       5      +
5        F     79  232    A       6      -

Answer 2

另一个班轮可以是：

df.loc[ df['strand'] == '-', 'start'] = df.loc[ df['strand'] == '-', 'start'] + 1

它使用loc进行索引。你知道吗

Answer 3

用途：

df[['start','end']]=np.where(df['strand'].eq('-')[:,None],
                np.column_stack((df['start']+1,df['end']-2)),
                df[['start','end']].values)
print(df)

---

  seqnames  start  end name  number strand
0        A     51  451    A       1      -
1        B     31  320    A       2      -
2        C     11  430    A       3      -
3        D     36  344    A       4      +
4        E     40  321    A       5      +
5        F     79  232    A       6      -