我们目前正在进行一个项目,我们需要从ClinVar获取“NPè”登录号。但是,当我们使用Entrez.eFetch公司()函数,结果中似乎缺少此信息。以下是网站页面的链接,其中列出了NP\编号:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/variation/558834/
下面是获取XML结果的Python示例脚本代码:
handle = Entrez.efetch(db="clinvar", id=558834, rettype='variation', retmode="text")
print(handle.read())
有趣的是,这个使用返回结果中的NP编号,然而,网站的格式/样式似乎与上次开发Python脚本时不同,我们现在似乎无法找到如何检索NP编号。你知道吗
任何帮助都将不胜感激!感谢您的时间和投入!你知道吗
您需要将其格式化为new query而不是old one:
另见:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/docs/maintenance_use/
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