如何在mac终端（BUSCO）上绕过Python上的“TypeError:conjusting to Unicode:need string or buffer，NoneType”消息

Question

我正在尝试运行BUSCO使用FASTA文件使用我的mac命令行。不幸的是，在这样做时，我收到以下消息：

$busco-i/卷/工作/研究\u项目/假单胞菌\u putida/ncbi-基因组-2018-10-24/GCA \u 000007556.2 \u ASM756v2_基因组.fna-o/users/williamimart/Desktop/test-l//Volumes/WORK/research\u project/busco\u datasets/gammaproteobacteria\u odb9-m geno 最大区域数限制为：3 回溯（最近一次呼叫）： 文件“/Users/williamimart/miniconda2/bin/busco”，第204行，in 如果模式=='基因组'和操作系统访问(操作系统环境获取（'AUGUSTUS\u CONFIG\u PATH'），os.W\u OK）=假： TypeError:强制为Unicode:需要字符串或缓冲区，未找到NoneType

我能做些什么来解决这个问题？你知道吗

Answer 1

我猜您需要导出AUGUSTUS_CONFIG_PATH。如果没有配置变量，os.environ.get()是一个可以返回None的地方

默认值对我来说并不清楚，因为我没有使用这个库的经验，但是添加它的方法是运行

export AUGUSTUS_CONFIG_PATH=/some/path/to/conf

检查他们的文档以确定要将路径值设置为什么