通过计算clus加载python模块

Question

我有一个帐户到一个使用科学Linux的计算集群。当然我只有用户权限。我正在使用python，需要运行python脚本，因此需要导入一些python模块。由于我没有root访问权限，我在$HOME上安装了一个本地python副本，其中包含所有必需的模块。当我在我的帐户（宿主节点）上运行脚本时，它们运行正常。但是为了将作业提交到计算队列（在速度更快的机器上处理），我需要提交一个bash脚本，该脚本有一行执行脚本。计算集群使用SunGrid引擎。但是，当我提交bash脚本时，出现了一个错误：找不到我安装的模块！你知道吗

所以我对这个问题的理解是模块没有被发送到执行脚本的机器上。我的问题是：是否可以在脚本中包含所有模块？你知道吗

编辑：我刚刚创建了一个运行which python的bash脚本，我注意到输出不是我的python副本。但是当我在ssh帐户上运行'which python'时，我得到了正确的python副本。。你知道吗

Answer 1

提交的脚本很可能使用系统Python安装，而不是您自己的。尝试只使用一个命令which python提交shell脚本以进行确认。你知道吗

修复方法是将Python解释器的路径预先添加到系统路径。在我的机器上，正确的Python安装在/Users/mbatchkarov/anaconda/bin/python。我把export PATH="/Users/mbatchkarov/anaconda/bin:$PATH"加到~/.bash_profile

编辑将同一行添加到~/.bashrc。你知道吗