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Python无法安装sklearn

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提问于 2025-04-18 16:43

我在使用 Ubuntu 14。我下载了 sklearn 的 dpkg 包并解压了它。我尝试运行 sudo python setup.py install，但似乎卡在一个循环里。

    compiling C++ sources
C compiler: c++ -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -fPIC

creating build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/src
compile options: '-Isklearn/utils/src -I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
c++: sklearn/utils/src/MurmurHash3.cpp
c++ -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/murmurhash.o build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/src/MurmurHash3.o -Lbuild/temp.linux-x86_64-2.7 -o build/lib.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/murmurhash.so
building 'sklearn.utils.lgamma' extension
compiling C sources
C compiler: x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC

compile options: '-Isklearn/utils/src -I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
x86_64-linux-gnu-gcc: sklearn/utils/lgamma.c
x86_64-linux-gnu-gcc: sklearn/utils/src/gamma.c
x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/lgamma.o build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/src/gamma.o -Lbuild/temp.linux-x86_64-2.7 -lm -o build/lib.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/lgamma.so
building 'sklearn.utils.graph_shortest_path' extension
compiling C sources
C compiler: x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC

compile options: '-I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
x86_64-linux-gnu-gcc: sklearn/utils/graph_shortest_path.c
In file included from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1761:0,
                 from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:17,
                 from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:4,
                 from sklearn/utils/graph_shortest_path.c:256:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/npy_1_7_deprecated_api.h:15:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " "#defining NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION" [-Wcpp]
 #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " \
  ^
In file included from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ufuncobject.h:327:0,
                 from sklearn/utils/graph_shortest_path.c:257:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/__ufunc_api.h:241:1: warning: ‘_import_umath’ defined but not used [-Wunused-function]
 _import_umath(void)
 ^
x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/graph_shortest_path.o -Lbuild/temp.linux-x86_64-2.7 -o build/lib.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/graph_shortest_path.so
building 'sklearn.utils.fast_dict' extension
compiling C++ sources
C compiler: c++ -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -fPIC

compile options: '-I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
c++: sklearn/utils/fast_dict.cpp
In file included from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1761:0,
                 from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:17,
                 from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:4,
                 from sklearn/utils/fast_dict.cpp:320:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/npy_1_7_deprecated_api.h:15:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " "#defining NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION" [-Wcpp]
 #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " \
  ^
sklearn/utils/fast_dict.cpp: In function ‘PyObject* __pyx_pw_7sklearn_5utils_9fast_dict_1argmin(PyObject*, PyObject*)’:
sklearn/utils/fast_dict.cpp:18786:44: warning: ‘__pyx_v_min_key’ may be used uninitialized in this function [-Wmaybe-uninitialized]
             return PyInt_FromLong((long)val);
                                            ^
sklearn/utils/fast_dict.cpp:3316:46: note: ‘__pyx_v_min_key’ was declared here
   __pyx_t_7sklearn_5utils_9fast_dict_ITYPE_t __pyx_v_min_key;
                                              ^
In file included from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ufuncobject.h:327:0,
                 from sklearn/utils/fast_dict.cpp:321:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/__ufunc_api.h: At global scope:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/__ufunc_api.h:241:1: warning: ‘int _import_umath()’ defined but not used [-Wunused-function]
 _import_umath(void)
 ^

.. 然后就一直这样。

我已经安装了 numpy，但我是通过 Ubuntu 的软件中心安装的。当我在 Python 中尝试导入 sklearn 时，出现了以下错误：

from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier 追踪（最近的调用最后）： 文件 "", 第 1 行， 在 文件 "sklearn/init.py", 第 37 行， 在 from . import check_build 文件 "sklearn/__check_build/__init.py", 第 46 行， 在 raise_build_error(e) 文件 "sklearn/check_build/__init.py", 第 41 行， 在 raise_build_error %s""" % (e, local_dir, ''.join(dir_content).strip(), msg)) 导入错误：没有名为 _check_build 的模块 _______________________________________________________________________ sklearn/check_build 的内容: setup.py
__init.py _check_build.pyx _check_build.c setup.pyc init.pyc _______________________________________________________________________ 看起来 scikit-learn 没有正确构建。

如果你是从源代码安装 scikit-learn，请不要忘记在使用之前构建这个包：在源代码目录中运行 python setup.py install 或 make。

如果你使用了安装程序，请检查它是否适合你的 Python 版本、操作系统和平台。

我不知道 sklearn/check_build 在哪里。

我在 /usr/lib/python2.7/dist-packages 的文件夹是空的，但我可以在 Python 中导入 numpy。就像我说的，我是通过 Ubuntu 软件中心安装 numpy 的，但 sklearn 不是，我现在很后悔这样做。

ubuntu numpy 依赖管理 模块导入 数据科学 安装错误 scikit-learn 软件包构建

3 个回答

0

处理环境问题的新方法之一是使用 Docker 镜像。这样，任何开发者都可以在一分钟内在任何服务器上重建相同的环境。你可以从 这里 下载这个镜像。

使用 datmo CLI 工具也可以很简单地做到这一点。我们自己遇到了这些问题，因此决定开发这个工具。

补充说明：你可以按照以下方式安装，

apt-get update; \
apt-get install -y python python-pip \
                    python-numpy \
                    python-scipy \
                    build-essential \
                    python-dev \
                    python-setuptools \
                    libatlas-dev \
                    libatlas3gf-base

update-alternatives --set libblas.so.3 /usr/lib/atlas-base/atlas/libblas.so.3; update-alternatives --set liblapack.so.3 /usr/lib/atlas-base/atlas/liblapack.so.3

pip install -U scikit-learn

免责声明：我在 Datmo 工作

回答于 2025-04-18 由 Python大师
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如果你希望你的包管理工具能处理所有事情，这通常是可行的，不过你可能不会使用到最新版本。

否则，可以尝试以下步骤：

sudo apt-get install build-essential gcc g++ python-dev python3-dev python-scipy python3-scipy

然后再试着安装或编译一次。编译Python扩展模块需要有一个正常工作的编译环境，以及Python的扩展或开发头文件。我不太确定这些依赖项在Ubuntu上是否完全正确，因为我最近主要在使用openSUSE，但你可以通过apt-cache search来找到正确的名称，如果我有打错的话。

回答于 2025-04-18 由 Python大师
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我建议你通过Anaconda这个工具来安装sklearn和它需要的所有依赖包。你可以在这里找到下载链接：https://www.continuum.io/downloads#_unix

这样安装的时候，numpy和其他一些包也会一起安装，具体的包列表可以在这里查看：http://docs.continuum.io/anaconda/pkg-docs

回答于 2025-04-18 由 Python大师
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