自定义函数,以改善matplotlib绘图的外观,以实现科学可视化。
sciplotlib的Python项目详细描述
sciplotlib公司
sciplotlib只是一组简单的函数和样式表,用于更专业的绘图
有两个主要特性使图纸中的图看起来和它们一样:
- 默认样式属性,例如字体、配色方案
- 根据刻度线或添加到绘图中的其他元素(如阴影或阴影)的位置的特定选择
样式表
sciplotlib旨在通过提供旨在模拟科学论文中的样式属性的样式表来简化(1):
我们可以将默认matplotlib样式与模仿Nature publishing group文章中的散点图的样式进行比较:
importmatplotlib.pyplotaspltimportnumpyasnpdefmake_plot():fig,ax=plt.subplots()num_categories=10num_points=10forcategoryinnp.arange(num_categories):x=np.random.normal(size=num_points)y=np.random.normal(size=num_points)ax.scatter(x,y)returnfig,axfig,ax=make_plot()ax.set_title('Default matplotlib style')
应用最基本的样式只是一行代码
^{pr2}$修改地物属性
sciplotlib还旨在通过提供自动添加科学绘图中的元素的函数来简化(2)。例如,在许多科学期刊中,轴通常只从最后一个刻度线延伸到最后一个刻度线,在《自然》评论文章中发现的图形中,阴影也很常见,这些都是通过simpy在图形句柄中获取并返回它们的函数来实现的:
fromsciplotlibimportstyleasspstylefromsciplotlibimportpolishassppolishwithplt.style.context(spstyle.get_style('nature-reviews')):fig,ax=make_plot()fig,ax=sppolish.set_bounds(fig,ax)sppolish.apply_gradient(ax,extent=None,direction=0.3,cmap_range=(0.1,0),cmap='Greys')ax.set_title('Nature reviews style with bells and whistles')
安装
简单地做
pip install sciplotlib
致谢
sciplotlib构建在matplotlib之上。要在出版物中引用matplotlib,请引用:
J.D.Hunter,“Matplotlib:二维图形环境”,科学与工程计算,第9卷,第3期,第90-95页,2007年
其他基于为科学图提供样式表/包装器的项目包括:
科学论文的调色板来自奇妙的ggsci
库:
https://cran.r-project.org/web/packages/ggsci/vignettes/ggsci.html
贡献
如果您有兴趣向此存储库添加新函数或模板,请与我联系。在
其他有趣的东西
我还包括其他审美愉悦的情节风格,是非学术。例如,要从《经济学人》创建图,请执行以下操作:
importnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltfromsciplotlibimportstyleasspstylefromsciplotlibimportmiscasspmiswithplt.style.context(spstyle.get_style('economist')):fig,ax=plt.subplots()ax.scatter(x,y)ax.text(0,1.2,'Main title',weight='bold',size=13,transform=ax.transAxes)ax.text(0,1.1,'This is the usual long subtitle',transform=ax.transAxes)fig,ax=spmisc.add_economist_rectangle(fig,ax,xloc=0.125,yloc=1.1,width=0.05,height=0.02)fig,ax=spmisc.add_datasource(fig,ax,s='Source: IMF',xloc=0.125,yloc=0,alpha=0.6)
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