Python rnacounter-1.5.2.tar.gz模块包


下面是该Python项目安装包的资源下载地址:

  • rnacounter-1.5.2.tar.gz.source

  • 文件名称:rnacounter-1.5.2.tar.gz

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    所属PyPI项目:rnacounter


  • 文件大小: 302.9 kB

    文件类型: Source

    适用的Python版本:None

    下载文件的哈希值:
        SHA256:7bcb98bbde40529d94df1fb803a014ad90deff36ed0bc52781b223c7325ec84e
        MD5:e45eccb4554d2715e60a3f95b7b441a0
        BLAKE2-256:a2ea657e7b7aa7d777173695606509933b52d794b7dbb79501a87bfea2fb511f






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PyPI项目包:rnacounter

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rnaccounter估算基因及其不同转录本的丰度 从读取对齐。外显子和内含子也可以量化。

它在注释的基因组特征中提供了快速的读取计数,并且简单, 从rna序列数据中量化亚型的有效方法。 使用的方法在[<;ref>;]中有说明。 对于来自鼠标的1GB BAM文件,典型的运行时间预计不到2分钟 rna测序,随bam大小线性增加。

对于所有这些任务,它只需要一个来自基因组上读取映射的BAM文件,

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