pyCTQW 1.1.0

功能

• Fortran和Python绑定（分别以库和模块的形式）
• 通过使用petsc和slepc高性能稀疏支持mpi 矩阵库（计划支持CUDA）
• 内置对无限线哈密顿量的支持
• 以二进制或文本形式导入和导出矩阵/状态
• 可以导入自定义邻接矩阵
• 支持一个和两个步行者（非交互）
• 以二进制、文本或matlab格式导入和导出矩阵/状态
• python模块支持使用matplotlib和networkx进行绘图和可视化
• 纠缠计算
• 在图顶点上放置对角线缺陷/屏障的能力
• MPI图同构方法，用于2和3个相互作用粒子

待办事项

• CUDA支持
• 传输计算
• 当不存在PETSc/SLEPc时添加回退模式

依赖关系

除了MPI实现（例如MPICH或Open MPI），python pyCTQW.MPI模块还依赖于以下组件：

• Python>；=2.7
• NumPy>；=1.6.0
• PETSc>；=3.4.2
• SLEPc>；=3.4.1
• petsc4py 3.4 or petsc4py-dev
• mpi4py（推荐，用于某些绘图）
• matplotlib（推荐用于节点绘制和图形可视化）
• SciPy（推荐，用于某些I/O操作）
• NetworkX（推荐，图形可视化）

使用pip安装

在确保安装了numpy和petsc4py（并且正确设置了所有的petsc、slepc和mpi环境变量）之后，可以使用pip：

$ pip install pyCTQW

从源代码安装

或者，可以手动下载和编译源代码：

1. 确保安装了上面要求的所有依赖项

2. 将pyCTQW文件夹和cd提取到提取的目录：

   $ tar xvzf pyctqw-1.1.0.tar.gz
   $ cd pyctqw-1.1.0
   

3. 确保您的petsc和slepc环境变量设置正确；例如，

   $ exportPETSC_DIR=/path/to/petsc
   $ exportPETSC_ARCH=linux-gnu
   $ exportSLEPC_DIR=/path/to/slepc
   

   If you are unsure what your PETSc or SLEPc variables should be, please refer to their documentation.

   Important

   If you plan to install ^{tt1}$ using ^{tt5}$ to a system directory, the PETSc and SLEPc environment variables must be available to the root user.

4. 通过运行

   $ python setup.py build
   

5. 全系统安装：

   $ sudo -E python setup.py install
   

   where the command ^{tt7}$ ensures that the environment variables set in step 3 are passed to the root.

   Note

   If you do not have root access, or the above command does not appear to work, you can install the package locally by running

   $ python setup.py install --user
   

   Now, have a go running some of the examples!

可选：编译libctqwMPI

除了MPI实现（例如MPICH或Open MPI），Fortran库^{TT8}$还依赖于以下组件： -PETSc>；=3.4.2个 -SLEPc>；=3.4.1

安装这些依赖项后，只需在根目录pyCTQW-X.Y中打开一个终端并运行

$ make fortran [options]

可用选项包括

fortran库（libctqwMPI.so或libctqwMPI.a）可以在pyCTQW-X.Y/lib目录中找到，所需的模块文件可以在pyCTQW-X.Y/include目录中找到

可选：生成文档

如果安装了Sphinx，则可以通过运行

$ pip install -r docs/requirements.txt
$ make docs

文件

有关如何使用此软件包的详细信息，请参见online documentation

致谢

图形同构子程序GraphISCert使用外部子程序d_refsor，这是由michel olagnon编写的高度优化的fortran排序实现，也是fortran 90排序和排序算法ORDERPACK 2.0套件的一部分。