用FASTA输入抽象出运行gnuparallel的工具,并为这些工具生成的一些常见格式提供解析器。
ope的Python项目详细描述
手术室
抽象出运行gnu parallel的工具和FASTA输入,并为一些常见的 所述工具生成的格式。在
用法示例:
ope parallel -j 4 [query.pep.fa] hmmscan --domtblout [results.tbl] -E 1e-05 -o /dev/null /store/biodb/Pfam-A.hmm /dev/stdin
因此,唯一需要担心的gnu parallel标志是使用的内核数的-j。 注意,您还需要将实际工具调用中的输入设置为/dev/stdin。在
- 免费软件:麻省理工学院许可证
- 文档:https://ope.readthedocs.io。在
特点
- 托多
学分
此包是用Cookiecutter和audreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。在
历史
- PyPI的第一个版本。在
- 项目
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