神经影像学研究的元分析

neuroquer的Python项目详细描述


Build Statuscodecov

Binder

神经查询

神经查询是一个工具和统计模型的荟萃分析功能 神经影像学文献。

给定一个文本查询,它可以生成最相关的解剖结构的大脑地图 根据当前科学文献的结构。

它可以通过web界面使用:https://neuroquery.org

技术细节和广泛的验证在this paper中提供。

这个Python包允许脱机使用NeuroQuery或将其集成到其他 应用。

入门

Quick demo

依赖性

NeuroQuery需要Python3、numpy、scipy、scikit learn、nilearn、pandas, regex、nltk、lxml和请求。

python Levenshtein是一个可选的依赖项,仅在 标记化。如果使用neuroquery或中提供的词汇表 neuroquery_data不需要它。

安装

neuroquery可以与一起安装

pip install neuroquery

用法

examples文件夹中, ^{} 显示neuroquery的基本用法。

neuroquery有一个功能,可以下载经过训练的模型,这样用户就可以 立即开始:

^{pr2}$

neuroquery还提供类来训练科学界的新模型 出版物文本和立体定向峰值激活坐标(见 ^{} 在示例中)。

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