用于goget data（ggd）的cli
ggd的Python项目详细描述
#ggd cli
到ggd的命令行界面。构建并检查配方。
\使用：
```
$conda config--添加频道bioconda
$conda config--添加频道conda forge
$conda install-y conda build all--频道conda forge
$conda install-y anaconda client
$pip install-r requirements.txt
$conda install-y“gsort>；=0.0.2“samtools htslib zlib
```
最后：
`````
$pip install ggd
````
例如，我们不希望一个菜谱在用户空间中乱扔多余的文件，因此如果菜谱下载了一个`.zip`，并处理了其中的文件，那么它应该在完成时清理（`rm`）这个.zip文件。
```
用法：ggd from bash[-h]--species
{homo-sapiens，mus-musculus，canis-experiis}
--基因组构建基因组构建[--作者作者]--版本
版本[--依赖关系]
[--额外文件额外文件]--摘要摘要--关键字
关键字
名称脚本
位置参数：
名称配方< BR/>脚本BASH脚本，包含构建
配方< BR/> BR/>可选的参数：
-H，帮助显示此帮助消息并退出
物种{HyooSoopisMuxMuululus，犬科动物}
物种配方用于
--基因组构建基因组}
基因组构建配方用于
--配方的作者作者
--数据本身的版本版本，例如dbsnp-127
--依赖依赖性
任何软件依赖性（在bioconda，conda forge中）或数据依赖性（在ggd中）。可能是
所需的次数。
--额外文件额外文件
配方创建的任何不是*.gz
和*.gz.tbi对的文件。可以多次使用
--摘要摘要描述配方的注释
--关键字关键字与配方关联的关键字。可能
指定了不止一次。
```
运行“ggd check recipe”将
运行与测试框架相同的检查。它将生成并安装配方。
```
到ggd的命令行界面。构建并检查配方。
\使用：
```
$conda config--添加频道bioconda
$conda config--添加频道conda forge
$conda install-y conda build all--频道conda forge
$conda install-y anaconda client
$pip install-r requirements.txt
$conda install-y“gsort>；=0.0.2“samtools htslib zlib
```
最后：
`````
$pip install ggd
````
例如，我们不希望一个菜谱在用户空间中乱扔多余的文件，因此如果菜谱下载了一个`.zip`，并处理了其中的文件，那么它应该在完成时清理（`rm`）这个.zip文件。
```
用法：ggd from bash[-h]--species
{homo-sapiens，mus-musculus，canis-experiis}
--基因组构建基因组构建[--作者作者]--版本
版本[--依赖关系]
[--额外文件额外文件]--摘要摘要--关键字
关键字
名称脚本
位置参数：
名称配方< BR/>脚本BASH脚本，包含构建
配方< BR/> BR/>可选的参数：
-H，帮助显示此帮助消息并退出
物种{HyooSoopisMuxMuululus，犬科动物}
物种配方用于
--基因组构建基因组}
基因组构建配方用于
--配方的作者作者
--数据本身的版本版本，例如dbsnp-127
--依赖依赖性
任何软件依赖性（在bioconda，conda forge中）或数据依赖性（在ggd中）。可能是
所需的次数。
--额外文件额外文件
配方创建的任何不是*.gz
和*.gz.tbi对的文件。可以多次使用
--摘要摘要描述配方的注释
--关键字关键字与配方关联的关键字。可能
指定了不止一次。
```
运行“ggd check recipe”将
运行与测试框架相同的检查。它将生成并安装配方。
```
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