耳蜗核神经元模型
cochlear-nucleus的Python项目详细描述
一个python包,实现哺乳动物中ventral cochlear nucleus的globular bushy cells(gbcs)计算模型。 短期持留终球的唯象模型 突触抑制也包括在内。
安装
安装依赖项:
- python 2.7版
- 努比
- 神经元(与python绑定):http://neuron.yale.edu/neuron/
- 布莱恩:http://briansimulator.org/
克隆git repo时使用:
git clone https://github.com/mrkrd/cochlear_nucleus.git cd cochlear_nucleus
编译神经元模型:
make
或手动:
cd cochlear_nucleus/nrn && nrnivmodl cd -
安装软件包本身:
python setup.py develop --user
引用
Rudnicki M.和Hemmert W.(2017年)。高夹带约束 体内球形浓密细胞模型的突触抑制水平。 计算神经科学前沿,前沿媒体公司,2017,11, 第1-11页。 内政部:10.3389/fncom.2017.00016 https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fncom.2017.00016/full
bibtex条目:
@Article{Rudnicki2017, author = {Marek Rudnicki and Werner Hemmert}, title = {High Entrainment Constrains Synaptic Depression Levels of an In vivo Globular Bushy Cell Model}, journal = {Frontiers in Computational Neuroscience}, year = {2017}, volume = {11}, pages = {1--11}, month = {mar}, doi = {10.3389/fncom.2017.00016}, publisher = {Frontiers Media {SA}}, url = {https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fncom.2017.00016/full}, }
致谢
这项工作得到了德国研究基金会(DFG)的支持 “超快速时间精确信息”优先程序 处理:正常和功能失调听力“SPP 1608(HE6713),听力 曼城理工大学资助计划开放 访问出版,以及德国联邦教育部和 慕尼黑伯恩斯坦计算中心的研究 神经科学(参考号:01GQ1004B)。
许可证
该项目根据GNU通用公共许可v3或 稍后(GPLv3+)。