耳蜗核神经元模型

cochlear-nucleus的Python项目详细描述


一个python包,实现哺乳动物中ventral cochlear nucleusglobular bushy cells(gbcs)计算模型。 短期持留终球的唯象模型 突触抑制也包括在内。

用法

examples目录中查找示例(例如nrn_gbc_demo.py和 nrn_gbc_demo_with_default_weights.py)。注意一些例子 要求安装cochlea

安装

安装依赖项:

克隆git repo时使用:

git clone https://github.com/mrkrd/cochlear_nucleus.git
cd cochlear_nucleus

编译神经元模型:

make

或手动:

cd cochlear_nucleus/nrn && nrnivmodl
cd -

安装软件包本身:

python setup.py develop --user

引用

Rudnicki M.和Hemmert W.(2017年)。高夹带约束 体内球形浓密细胞模型的突触抑制水平。 计算神经科学前沿,前沿媒体公司,2017,11, 第1-11页。 内政部:10.3389/fncom.2017.00016 https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fncom.2017.00016/full

bibtex条目:

@Article{Rudnicki2017,
  author    = {Marek Rudnicki and Werner Hemmert},
  title     = {High Entrainment Constrains Synaptic Depression Levels of an In vivo Globular Bushy Cell Model},
  journal   = {Frontiers in Computational Neuroscience},
  year      = {2017},
  volume    = {11},
  pages     = {1--11},
  month     = {mar},
  doi       = {10.3389/fncom.2017.00016},
  publisher = {Frontiers Media {SA}},
  url       = {https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fncom.2017.00016/full},
}

致谢

这项工作得到了德国研究基金会(DFG)的支持 “超快速时间精确信息”优先程序 处理:正常和功能失调听力“SPP 1608(HE6713),听力 曼城理工大学资助计划开放 访问出版,以及德国联邦教育部和 慕尼黑伯恩斯坦计算中心的研究 神经科学(参考号:01GQ1004B)。

许可证

该项目根据GNU通用公共许可v3或 稍后(GPLv3+)。

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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