从cazy中提取特定信息的方法

cazy-parser的Python项目详细描述


cazy分析器

Carbohydrate-Active enZYmes Database (CAZy)提供了一种基于序列的酶分类,这种酶负责寡糖和多糖的组装、修饰和分解。

该数据库已在网上提供了十八年相关的糖类水解酶、糖基转移酶、多糖裂解酶、碳水化合物酯酶和类似的具有辅助活性的酶的基因组、结构和生化数据。数据库被分解成一系列高度注释的html表,并呈现给用户。

该脚本提供了一种根据用户需要从数据库中提取信息的方法。

安装

pip install --upgrade cazy-parser

文档

有关用法和详细信息,请参阅project page

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