FASTA文件读取器
fasta-reader的Python项目详细描述
fasta阅读器
FASTA文件读取器/写入器。在
示例
打开文件并循环其内容。在
fromfasta_readerimportread_fastaforiteminread_fasta("fasta_reader/test/correct1.faa"):print(item)# FASTAItem(defline='ID1', sequence='GAGUUA')# FASTAItem(defline='ID2', sequence='CAUAACAAATT')# FASTAItem(defline='ID3', sequence='AAGAA')# FASTAItem(defline='ID4', sequence='AAGAA')
打开压缩文件并显示第一项。在
^{pr2}$写入output.faa.gz。在
fromfasta_readerimportwrite_fastawithwrite_fasta("output.faa.gz")asfile:file.write_item("id1 gene x protein","AGUTAGA")file.write_item("id2 gene x protein","TUUA")
安装
pip install fasta-reader
作者
许可证
此项目在MIT License下获得许可。在
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